10x Multiome ATAC + Gene Expression
服務簡介
隨著單細胞測序技術快速普及，僅僅是單細胞轉錄組層面已經不足以全面解決問題，因為在高度協(xié)調的生物系統(tǒng)中，從基因到轉錄本再到蛋白會受到各種途徑的調控，包括表觀基因組調控和各種DNA/RNA修飾的調控，因此結合scATAC可以分析單細胞級別的染色質可及性，結合單細胞蛋白質組學可以分析細胞內部和細胞表面的蛋白質表達情況，有助于深入認知各種生理現(xiàn)象背后的機制。
產品提供了一種綜合的、可伸縮的多組學方法，用于檢測同一單個細胞核中的轉錄組信息和染色質可及性信息。與獨立的Chromium Next GEM單細胞ATACv1.1和Chromium Next GEM單細胞基因表達v3.1分析相比，這種多組學方法提供了一種可同時獲取同一個單細胞的基因組開放數(shù)據(jù)和轉錄組表達水平數(shù)據(jù)的技術，從而使研究人員可以將不同生物事件中的各種單細胞的基因組染色質開放信息與基因表達程度進行準確關聯(lián)，以便更好地在細胞和分子水平上對發(fā)育遺傳學、神經科學、免疫組學、腫瘤和其它疾病機理等關鍵生命科學領域開展深入研究。
技術路線
為同時獲得同一細胞的轉錄組和表觀組，首先利用Tn5轉座酶對細胞核懸液進行核DNA轉座，Tn5轉座酶優(yōu)先切割開放染色質區(qū)域中的核DNA。然后利用Chromium平臺進行單細胞基因表達（GEX）和ATAC文庫制備，該過程將單個細胞核、反應試劑與單個凝膠珠（Gel Bead）包裹成液滴（GEM）。凝膠珠同時包括帶有特異性條形碼、唯一分子標識符（UMI）的poly(dT)序列和帶有10x Barcode的Spacer序列，poly(dT)序列能夠捕獲具有poly(dA)尾的mRNA用于生成基因表達（GEX）文庫，Spacer序列能夠將條形碼添加到轉座的DNA片段上生成ATAC文庫。對得到的兩種文庫進行測序，并將來自同一細胞兩種文庫的測序數(shù)據(jù)通過10x Barcode匹配，即可實現(xiàn)同時對同一細胞的轉錄組和表觀組進行關聯(lián)。
應用領域
發(fā)育遺傳學
神經科學
免疫組學
腫瘤
其它疾病機理
儀器設備
10x Genomics Chromium X Series
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